Thuốc kháng sinh thường được dùng để điều trị và đôi khi để dự phòng bệnh nhiễm khuẩn. Thuốc kháng sinh được chia thành nhiều nhóm, mỗi nhóm lại có nhiều thế hệ và loại thuốc khác nhau. Các loại thuốc kháng sinh thế hệ mới không gây ảnh hưởng tới sự phát triển của xương và chiều cao của trẻ. Một ngoại lệ là thuốc tháng sinh nhóm tetracyclin nếu dùng kéo dài, thuốc có thể lắng đọng trong xương và mầm răng của trẻ, gây ảnh hưởng tới sự phát triển của răng và hệ xương. Bộ Y tế đã cấm sử dụng loại thuốc này cho trẻ em từ lâu. Tuy nhiên, dùng thuốc kháng sinh không phải là vô hại. Uống thuốc kháng sinh có thể gây ảnh hưởng tới hệ thống vi khuẩn đường ruột, gây táo bón, thiếu một số vitamin và gây mệt mỏi. Chính vì vậy việc dùng thuốc kháng sinh nào, liều lượng bao nhiêu và thời gian bao lâu cần theo đúng chỉ định của bác sĩ. Cũng cần cho trẻ uống thêm một số loại vitamin (vitamin A, C và vitamin nhóm B), bảo đảm bú mẹ, chế độ ăn bổ sung đa dạng và đủ chất.